אחת המטרות העיקריות של הבנק המרכזי של קפריסין הוא להבטיח שהמערכת הפיננסית בקפריסין תישאר יציבה ובטוחה וכן לשמור את אמון ביציבות הכלכלית ועידוד הצמיחה בקפריסין. מטרות אילו מושגות על ידי ניהול בנק מרכזי יעיל וחזק ומפוקח.
חלק מתפקידי הבנק המרכזי בקפריסין הוא מתן רשיונות למוסדות פיננסים ופיקוח על המוסדות – בנקים בקפריסין על מנת לשמור על לקוחות הבנקים.
הבנק המרכזי של קפריסין מוביל את הפיקוח על בנקים בקפריסין בהתאם לפרוטוקול ולהמלצות של וועדת באזל לפיקוח על הבנקים ולתקנות של האיחוד האירופי בדבר הרגולציה והשמירת היציבות. אחד הנושאים החשובים ביותר הוא הערכת "הסיכון המערכתי" של קפריסין. זאת אומרת מהוא התרחיש שבו תיהיה סכנה על היציבות הכללית בקפריסי ן(לדוגמא, הסיכון מערכתי היה חלק מהשיקולים לא להציל את ליהמן ברדרס בארה"ב בסוף 2008) .
הפיקוח של הבנק המרכזי מבוצע על ידי ניטור הן מחוץ לבנק והן בתוך הבנק עצמו. הבדיקות שנערכות מחוץ לבנק הם בעיקר ניטור של מסמכים הקשורים לבנק וליחסיו עם בנקים אחרים בקפריסין אשר מכסים היבטים רבים של הפעילות הבנקאית בקפריסין. כל חריגה קלה מהנהלים או פעילות בלתי ראויה מתגלים מיד.
בדיקות המתבצעות בתוך הבנק – בדיקות אליו בודקות את היציבות של הבנק, יחסים במאזן הבנק ופעילותו הכללית. הבדיקו מתבצעות במטרה להעריך את מצבו הכספי הנוכחי,יציבותו של הבנק והסיכונים לעתיד.
מבחינה זו, אילו התחומים העקריים שבנקים בקפריסין נבדקים:
- איכות הניהול של הבנק, לרבות היבטים של עמידה בנהלים פנימיים.
- תיק הלוואות של הבנק, עם דגש על ניהול סיכון האשראי על איכות תיק ההלוואות ואת ההתאמה של ההפרשות לחובות מסופקים.
- ניהול הנוסטרו של הבנק תוך דגש על ניהול סיכונים.
- עמידה ברישיון הבנקאות שניתן לבנק בתחומי הציות, הלימות הון, חשיפות לסקטורים שונים והלבנות הון.
- עמידה בדרישות החקיקה נגד הלבנות הון ועבירות פליליות כלכליות אחרות.
- הפיקוח מבוצע כל על הבנקים באותה שיטה והיא חלה על הבנק וחברות הבנות שלו.
חשוב לציין שקפריסין שייכת לאיחוד האירופי ולכן ופועלת בהתאם לתקנות האיחוד האירופי בנושאים הבנקים. ראוי לציון העובדה שבשנים האחרונות, גם בתקופת המשבר הבנקאי והמיתון הקשה, הבנקים בקפריסין הראו על יציבות פיננסית (בדומה לישראל) ולא נזדקקו לחילוצים כל שהן או לחדלות פרעון. השמרנות של המערכת הבנקאית הקפריסאית הוכיחה את עצמה.